Pour aller plus loin. Les deux brins de l'ADN sont maintenus l'un…

1. Séparer les brins, c'est rompre tous les ponts hydrogène de l'appariement. Chaque paire G--C en apporte $3$, chaque paire A--T seulement $2$ : à longueur égale, un ADN riche en G--C est retenu par $50\%$ de ponts en plus. Il faut donc une agitation thermique supérieure pour le dénaturer : son $T_m$ est plus élevé. (C'est vérifié : le $T_m$ croît linéairement avec le pourcentage de G--C, et les bactéries des sources chaudes ont un génome riche en G--C.)

2. Parce que l'information portée par l'ADN doit être lisible et recopiable. Une liaison covalente ($\approx 400\mathrm{kJ}/\mathrm{mol}$) serait définitive : aucune enzyme ne pourrait ouvrir la double hélice à température du corps sans détruire la molécule. Un pont hydrogène ($\approx 20\mathrm{kJ}/\mathrm{mol}$) est assez fort pour tenir les deux brins appariés de façon stable et assez faible pour être ouvert localement, à la demande, puis refermé. Et comme les ponts sont très nombreux, l'ensemble est solide alors que chacun est fragile.

Contrôle : c'est la même intensité intermédiaire qui rend l'eau liquide à $20{}^{\circ }$C et vaporisable à $100{}^{\circ }$C : le pont hydrogène est l'interaction du « réversible ».

Piège : confondre les deux niveaux d'interaction de l'ADN. Les nucléotides d'un même brin sont liés par des liaisons covalentes (le squelette sucre-phosphate, jamais rompu par la chaleur) ; ce sont seulement les deux brins entre eux qui sont appariés par ponts hydrogène.