Problème — Construire une phylogénie de Primates

On regroupe les espèces selon le partage d'états dérivés (1).

Les caractères « queue absente » et « caecum présent » sont partagés par l'Homme, le chimpanzé et le gorille, mais pas par le macaque. Ces trois espèces forment donc un groupe ayant un ancêtre commun exclusif, sur la branche duquel on place ces deux innovations. Le macaque se rattache à l'ensemble par un nœud plus ancien.

Le caractère « marche sur les phalanges » est partagé uniquement par le chimpanzé et le gorille : ils forment un sous-groupe avec un ancêtre commun plus récent, sur lequel on place cette innovation.

Le caractère « bipédie permanente » n'apparaît que chez l'Homme : c'est une innovation propre à la branche menant à l'Homme.

L'arbre se lit ainsi, de l'ancêtre le plus ancien au plus récent : un premier nœud sépare le macaque du reste ; un deuxième nœud (porteur de « queue absente » et « caecum présent ») donne naissance, d'un côté, à la branche de l'Homme (innovation : bipédie) et, de l'autre, à l'ancêtre commun du chimpanzé et du gorille (innovation : marche sur les phalanges). L'Homme est donc plus proche du chimpanzé et du gorille que du macaque, conformément aux données moléculaires.