Une structure complexe : la cellule vivante
Cours · enseignement scientifique (première), chapitre 3 · première, enseignement scientifique · le début du chapitre, la suite sur Adloun
3.1 Introduction : qu'est-ce qui sépare le vivant du non-vivant ?
Posez côte à côte un cristal de sel et une bactérie. Les deux sont faits des mêmes éléments chimiques — le chapitre précédent l'a montré, et le premier chapitre plus encore : il n'existe pas d'atome « vivant ». Les deux sont ordonnés. Les deux ont une forme définie. Et pourtant l'un est du sel et l'autre est vivant. Où passe exactement la frontière ?
La réponse n'est pas dans la matière, elle est dans l'organisation. Un cristal se répète : connaissant une maille, on les connaît toutes. Une cellule ne se répète pas : elle contient des milliers de molécules différentes, réparties en compartiments spécialisés, et surtout elle ne cesse de transformer ce qu'elle contient. Un cristal est une architecture ; une cellule est un chantier. Le cristal est stable parce qu'il ne fait rien. La cellule tient debout parce qu'elle travaille, en permanence, et parce qu'elle échange sans arrêt avec le monde extérieur. Coupez ces échanges, elle meurt.
Ce chapitre s'organise autour de trois questions.
- Comment l'a-t-on su ? La cellule n'est pas une évidence : c'est une découverte, et elle a été suspendue à un instrument. Sans microscope, pas de cellule ; sans microscope électronique, pas d'organites. L'histoire de cette découverte est le meilleur exemple, dans tout le programme, de la façon dont un concept naît d'une technique.
- De quelle taille parle-t-on ? Entre l'atome et l'organisme, il y a dix puissances de dix. Se tromper d'échelle, c'est ne rien comprendre : une confusion d'un facteur mille est ici la règle chez qui débute.
- Qu'est-ce qu'une cellule fait ? Elle est un milieu aqueux, séparé de l'extérieur par une membrane, qui a besoin d'énergie et qui échange en permanence. Cette phrase contient tout le reste du chapitre — y compris la question, étrangement difficile, de savoir si un virus est vivant.
Vous verrez ici de la biologie, bien sûr, mais aussi de la chimie (la molécule de phospholipide et son comportement dans l'eau), de la physique (la diffusion, la limite de résolution d'un instrument) et des mathématiques (échelles, proportionnalité, puissances de dix). Comme au chapitre précédent, le symbole signale les renvois vers la partie mathématique du livre.
3.2 Voir l'invisible : l'instrument avant le concept
3.2.1 : Hooke nomme une chose qu'il ne comprend pas
En , le savant anglais Robert Hooke publie Micrographia, un recueil d'observations faites au microscope composé qu'il a lui-même perfectionné. Il y examine une fine tranche de liège et y découvre un réseau de petites logettes vides séparées par des cloisons. Il les compare aux cellules d'un monastère et les nomme cells.
L'épisode mérite qu'on s'y arrête. Hooke n'a pas découvert la cellule vivante : le liège est un tissu mort, et ce qu'il voit sont des parois vides. Il n'imagine pas un instant que ces logettes soient l'unité de tous les êtres vivants. Il a seulement donné un nom à une régularité. Ce nom, pourtant, va rester — et ce sont des générations d'observateurs qui, lentement, vont lui donner un sens.
Les microscopes composés du XVIIe siècle souffraient d'aberrations si fortes que le grossissement utile dépassait rarement quelques dizaines de fois. Hooke pouvait distinguer des parois de liège, épaisses de plusieurs micromètres ; il ne pouvait voir ni noyau, ni membrane, ni organite. La limite de l'instrument fixait donc la limite du concept : on ne pouvait pas penser la cellule comme un contenu tant qu'on n'en voyait que le contenant.
3.2.2 Deux siècles pour passer de l'observation à la théorie
La découverte de l'unité cellulaire est liée à l'invention du microscope. L'observation de structures semblables dans de très nombreux organismes a conduit à énoncer le concept général de cellule et à construire la théorie cellulaire.
Deux choses, donc, et dans cet ordre : d'abord un instrument, ensuite une généralisation. Ce n'est pas une observation isolée qui fonde le concept, mais la répétition d'une même observation sur des matériaux extrêmement divers — plantes, animaux, tissus mous et durs. Ce passage de « j'ai vu ceci ici » à « il en est ainsi partout » est l'un des gestes fondamentaux de la démarche scientifique, et l'un des plus risqués.
conceptuel — le concept de cellule, la théorie cellulaire, l'exploration de l'intérieur de la cellule — suit de peu un progrès technique. La science n'avance pas seulement par de nouvelles idées : elle avance aussi par de
nouveaux yeux.— Leeuwenhoek voit bouger.
Antonie van Leeuwenhoek, drapier de Delft, n'est ni universitaire ni médecin. Il polit lui-même de minuscules lentilles sphériques et construit des microscopes simples, à une seule lentille, qui atteignent des grossissements de l'ordre de deux cents fois — bien supérieurs à ceux de Hooke. Dans une goutte d'eau de mare, il découvre un monde grouillant qu'il appelle animalcules. En , il observe, dans le tartre de ses propres dents, ce que nous appelons aujourd'hui des bactéries. Il communique tout cela à la Royal Society de Londres, dans des lettres en néerlandais, sans jamais publier de traité. On lui demande de recommencer devant témoins : il le fait. La science exige la reproductibilité, et elle l'exige d'autant plus fermement que le résultat est extraordinaire.
— Brown voit le noyau.
Le botaniste écossais Robert Brown, en examinant des cellules d'orchidées, remarque dans chacune un corpuscule constant, qu'il nomme nucleus, le noyau. Pour la première fois, la cellule n'est plus une case vide : elle a un contenu structuré.
- — Schleiden et Schwann généralisent.
Matthias Schleiden montre en que tous les tissus végétaux sont formés de cellules. L'année suivante, Theodor Schwann, physiologiste, étend la conclusion aux animaux, y compris à des tissus où l'organisation cellulaire n'est pas évidente, comme le cartilage ou l'os. La théorie cellulaire est née : tout être vivant est constitué d'une ou plusieurs cellules. C'est une unification comparable, dans son ambition, à celle que Newton avait opérée entre la chute des corps et le mouvement des planètes.
— Virchow ferme le cercle.
Reste une question : d'où vient une cellule ? Schwann pensait encore qu'elles pouvaient se former par cristallisation à partir d'un fluide. Rudolf Virchow tranche par une formule restée célèbre : omnis cellula e cellula, « toute cellule provient d'une cellule ». La théorie cellulaire prend alors sa forme définitive et devient aussi une théorie de la filiation : il n'y a pas de commencement spontané.
— Pasteur enterre la génération spontanée.
L'affirmation de Virchow demandait une preuve expérimentale. Louis Pasteur la fournit avec ses ballons à col de cygne : un bouillon nutritif bouilli puis laissé au contact de l'air, mais dont le col recourbé retient les poussières, ne se trouble pas — pendant des mois. Cassez le col, et il se trouble en quelques heures. La conclusion est nette : les micro-organismes ne naissent pas du bouillon, ils viennent de l'air. L'expérience est un modèle du genre, parce qu'elle ne supprime pas seulement une hypothèse : elle isole un seul facteur, le contact avec les poussières, tout le reste étant identique.
3.2.3 Le microscope électronique ouvre l'intérieur
Plus récemment, l'invention du microscope électronique a permis l'exploration de l'intérieur de la cellule et la compréhension du lien entre échelle moléculaire et cellulaire.
Le microscope optique bute sur une limite qui n'est pas un défaut de fabrication : c'est une loi physique. Deux points plus rapprochés qu'environ la moitié de la longueur d'onde de la lumière utilisée ne peuvent pas être distingués, quelle que soit la qualité des lentilles. Avec de la lumière visible, cela fixe la limite vers micromètre. Aucune amélioration du verre n'y changera rien.
En , Ernst Ruska et Max Knoll construisent le premier microscope électronique : au lieu de lumière, il utilise un faisceau d'électrons, dont la « longueur d'onde » associée est des milliers de fois plus courte. Dès l'instrument dépasse le microscope optique ; il atteindra le dixième de nanomètre, c'est-à-dire la taille d'un atome. Ruska recevra le prix Nobel de physique en , cinquante-cinq ans après son invention.
Ce que l'on découvre alors change tout. La cellule n'est pas un sac homogène : elle est compartimentée en organites, chacun spécialisé. Et surtout, on peut enfin relier ce que l'on voit — une membrane de huit nanomètres d'épaisseur — à ce que la chimie décrit — une double couche de molécules de lipides. L'échelle cellulaire et l'échelle moléculaire se rejoignent.
Méthode : Analyser et interpréter un document historique
Un texte, une planche gravée, une lettre : ces documents sont des sources, et ils se lisent avec méthode.
- Dater et situer. Qui écrit, quand, pour qui ? Une lettre privée à la Royal Society, un traité imprimé et un manuel scolaire n'ont ni le même statut ni le même public.
- Identifier l'instrument et ses limites. Quel grossissement ? Quelle préparation ? Ce que l'auteur ne pouvait pas voir explique souvent ce qu'il n'a pas compris. Reprocher à Hooke de n'avoir pas vu le noyau serait un anachronisme.
- Séparer l'observation de l'interprétation. « J'ai vu des logettes » est une observation ; « ce sont les briques du vivant » est une interprétation, et elle n'est pas de Hooke. Cette distinction est la clef de l'exercice.
- Chercher ce qui est généralisé, et sur quoi. La force de Schwann n'est pas d'avoir observé mieux que les autres, c'est d'avoir observé sur des tissus très différents. L'étendue de l'échantillon fait la solidité de la généralisation.
- Repérer les résistances et les controverses. Une idée qui s'impose sans discussion est rare. Qui s'opposait ? Avec quels arguments ? La génération spontanée n'était pas une sottise : c'était une hypothèse raisonnable, que seule une expérience bien conçue a pu écarter.
- Conclure sur l'apport propre du document, en une phrase, sans réécrire l'histoire à l'envers.
Schwann, : « il y a un principe de développement commun aux parties les plus diverses des organismes, et ce principe est la formation des cellules ». Virchow, : omnis cellula e cellula. La première phrase énonce une unité de structure ; la seconde ajoute une continuité de filiation. La différence n'est pas de style : Schwann admettait encore une formation de cellules à partir d'un liquide informe, ce que Virchow exclut. Seize ans séparent les deux propositions, et c'est le temps qu'il a fallu pour achever la théorie.
3.3 Les échelles du vivant
3.3.1 Dix puissances de dix
instrument permet d'atteindre. Les zones se recouvrent : le microscope optique voit la cellule et les plus gros organites, mais pas les virus ni les molécules. C'est exactement la raison pour laquelle les virus sont
restés invisibles jusqu'en .Méthode : Situer les ordres de grandeur : atome, molécule, organite, cellule, organisme
Retenir un repère par niveau, et raisonner ensuite par facteurs de dix.
| Niveau | Ordre de grandeur | Exemple |
|---|---|---|
| Atome | nm m | carbone, oxygène |
| Petite molécule | à nm | eau, glucose |
| Grosse molécule | à nm | une protéine, l'ADN (diamètre nm) |
| Membrane (épaisseur) | nm | la membrane plasmique |
| Virus | à nm | grippe, vih |
| Ribosome | nm | --- |
| Organite | à m | mitochondrie, noyau, chloroplaste |
| Bactérie | à m | Escherichia coli |
| Cellule eucaryote | à m | cellule de la peau, de l'oignon |
| Organisme | à m | un ciron, un être humain, un séquoia |
Deux réflexes. Toujours convertir en écriture scientifique avant de comparer ( m m ; nm m). Et toujours exprimer le résultat comme un rapport : « la cellule est mille fois plus grande que la bactérie » est plus parlant que deux nombres côte à côte.
Échelle, proportionnalité : voir la partie mathématique du livre, et l'annexe « Automatismes » pour les puissances de dix.